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HSV感染的診斷要依據(jù)病史、臨床表現(xiàn)和實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果而定。有不潔性交史,而且在生殖器部位出現(xiàn)皮膚紅斑和原發(fā)性水皰,易復(fù)發(fā)等不難診斷。必要時(shí)可作皰液涂片,培養(yǎng)、接種、免疫熒光檢查。血清免疫抗體測(cè)定等,均有助于診斷和確定病毒類(lèi)型。
一、細(xì)胞學(xué)方法
對(duì)皮損刮片做Wright-Gemsa (Tzanck試驗(yàn))或Papanicolaou染色,可檢出HSV感染特征的巨細(xì)胞包函體,但不能區(qū)別HSV感染或水痘— 帶狀皰疹病毒感染,敏感性?xún)H為病毒分離的60%。
二、培養(yǎng)法
從水皰底部取材做組織培養(yǎng)分離病毒,為目前較敏感、最特異的檢查方法,需5-10天,因其技術(shù)條件要求高,價(jià)格昂貴,不能普遍使用。
三、抗體檢測(cè)
目前最廣泛的是HSV-2抗體檢測(cè),如蛋白印跡法也可用gD2作抗原檢測(cè)HSV-2抗體,具有敏感性,且能區(qū)分HSV-1和HSV-2的優(yōu)點(diǎn)。
四、基因診斷
(一)用PCR分型檢測(cè)單純皰疹病毒
PCR是一種敏感性高,特異性強(qiáng)的快速檢測(cè)方法,標(biāo)本中含有1fg HSV-DNA就可以檢出,其在HSV感染的診斷研究中發(fā)展較快,且分型檢測(cè)HSV是發(fā)展的趨勢(shì)。
1、標(biāo)本采集和處理
(1)標(biāo)本采集
①腦脊液:直接無(wú)菌采取患者0.5ml腦脊液標(biāo)本于無(wú)菌試管送檢.如肉眼可見(jiàn)血色,應(yīng)離心取上清。
②羊水及嬰兒血清: 同上,應(yīng)避免溶血.
③腦組織: 腦組織尸檢、活檢標(biāo)本,加1ml PBS標(biāo)本緩沖液研磨后,待檢。
④眼及皮膚病灶分泌物:用預(yù)測(cè)(半干)棉拭子直接取患處分泌物,置1ml PBS標(biāo)本緩沖液中送檢。
⑤生殖器(宮頸、陰道、外陰、陰莖)標(biāo)本:先用消毒棉拭子擦去病變部位表面粘液、污垢,再用預(yù)潮棉拭子用力擦拭患處分泌物,置1ml PBS標(biāo)本緩沖液中送檢。
(2)標(biāo)本處理
①預(yù)處理:所有液體標(biāo)本均可直接進(jìn)行模板制備;可以取100μl標(biāo)本液,離心5000r/ min×5min后,去上清,取沉淀物進(jìn)行模板制備。
②模板制備:a: 蛋白酶K消化裂解法:沉淀物加100μl蛋白酶K消化裂解液,55℃1h后,煮沸10 min,離心5000 r/ min×5min,收集上清。 b:水煮法:沉淀物加100μl蒸餾水,搖均水煮20 min,離心5000 r/ min×5min收集上清。c:1%Triton X-100裂解法:取采集的標(biāo)本液100μl,加入1μl Triton X-100,水煮20 min,5000 r/ min×5min,收集上清。d: 5%NP-40裂解法:取采集的標(biāo)本液100μl,加5μl NP-40,水煮20 min ,5000r/ min×5min收集上清。e:如標(biāo)本溶血嚴(yán)重經(jīng)上述裂解處理后,再加等體積酚-氯仿抽提、冷乙醇沉淀DNA,加10μlDW溶解待檢。
2、PCR擴(kuò)增
(1)引物設(shè)計(jì)。以HSV DNA聚合酶的高保守區(qū)為檢測(cè)靶序列以確保特異性。設(shè)計(jì)3個(gè)引物,一個(gè)上游共同性引物,DNAP5(5′ATGGTGAAAACATCGACATGTACGG3′):二個(gè)下游特異性引物,DNAP3-1(5′CCTCGCGTTCGTCCTCGTCCTCC3′?。┖虳NAP3-2(5′CCTCCTTGTCGAGGCCCCGAAAC3′),可以分別擴(kuò)增出HSV-1469bpDNA片段(1981~2359)、HSV-2 391bp片段(1561~1953):從二型PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中設(shè)計(jì)了一個(gè)不分型的特異性探針HSVP3 5‘GGCGTAGTAGGCGGGGATGTCGCG 3‘)。
(2)PCR實(shí)驗(yàn)體系。取模板10μl: DNAP5 0.5(0.2μmol/L):DNAP3-10.5μl (0.2μmol/L):DNAP3-2 0.5μl (0.2μmol/L):4×dNTP 8μl(4×200μmol/L):10×dNTp 8μl(4×200μmol/L);10×緩沖液10μl:DMSO 4μl;加DW65.5μl;石蠟油 30μl.。
3.?dāng)U增產(chǎn)物的檢測(cè)和分析
(1)瓊脂糖凝膠電泳染色法:取擴(kuò)增產(chǎn)物20μl加樣品緩沖液4μl混勻后,點(diǎn)樣于2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳15~20min,溴化乙錠(EB)染色5min,于紫外燈下觀察結(jié)果在溴酚藍(lán)后面有一條或二條亮紅帶為陽(yáng)性結(jié)果,HSV-2帶在前,HSV-1帶在后,無(wú)帶則為陰性結(jié)果。
(2)XhoI酶譜法:取HSV-1型PCR產(chǎn)物50μl加X(jué)hoI50U,37℃1h后,置3%瓊脂糖凝膠中,70V電泳15~20min,可產(chǎn)生46bp片段帶(引物后面);與正常PCR產(chǎn)物比較,XhoI酶切后的大片段電泳位置前移。
(3)Southern印跡法:PCR產(chǎn)物20μl經(jīng)電泳分離后,用變性液處理60min,再用中和液處理90min,轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上:80℃烤膜2 h,42℃預(yù)雜交(雜交液中)30min,加入32p標(biāo)記HSVP3探針后,42℃雜交過(guò)夜;次日用1%SDS/ PBs pH7.2, 42℃洗15min, 0.5%SDS/PBS pH7.2, 42℃洗15min; 膜置X線(xiàn)暗盒內(nèi)放射性自顯影12~15h,顯影為陽(yáng)性, 不顯影為陰性。
(二)套式PCR
套式PCR(nested primers-polymerase chain reaction,NP-PCR)是通過(guò)“外側(cè)”、“內(nèi)側(cè)”兩對(duì)引物,即一對(duì)擴(kuò)增較大DNA片段的“外側(cè)”引物和一對(duì)位于擴(kuò)增產(chǎn)物中再擴(kuò)增小片段的“內(nèi)側(cè)”引物,這樣兩次連續(xù)放大可以提高PCR檢測(cè)的靈敏度,保證產(chǎn)物的特異性。但該方法不能分型,能100%檢出HSV-1,50%檢出HSV-2,應(yīng)改進(jìn)分型檢測(cè)HSV,更好地在臨床應(yīng)用和基礎(chǔ)研究中推廣應(yīng)用。
1、 標(biāo)本處理:
(1)標(biāo)本采集同上
(2)DNA 制備:①腦脊液:取100μlCSF 水煮15min,加入250μl無(wú)水乙醇,放-30℃10min;離心10000g30 min,去上清,30℃干燥后,加入10μl DW; ②腦組織細(xì)胞:取沉淀物加100μl蛋白酶K消化裂解液,56℃作用1h,水煮10min;取上清加入等體積酚一氯仿(V/V),輕搖10 min,離心10000r/min×10min;取水相,加入250μl DW溶解。
(1)引物設(shè)計(jì):選擇HSV1糖蛋白D基因?yàn)闄z測(cè)靶基因。
NP-PCR 的引物和探針序列
(2) PCR實(shí)驗(yàn)體系和程序: 反應(yīng)體積為50μl;模板10μl;BJHSV1.10.5μl(0.2pmol/L); BJHSV1.2 0.5μl(0.2pmol/L); 10×緩沖液5μl; 4×dNTp 4μl(4×200mmol/L);DW 27μl; 石蠟油30μl。循環(huán)參數(shù)為95℃30s;55℃30s; 72℃60s; 循環(huán)20次, 取其擴(kuò)增產(chǎn)物1μl加入含有BJHSV1.3和BJHSV1.4反應(yīng)體系中進(jìn)行套式擴(kuò)增,先95℃變性2min,循環(huán)參數(shù)為95℃30s;55℃30s; 72℃60s; 循環(huán)30次后,72℃延伸5min;。
(3) 擴(kuò)增產(chǎn)物分析:
① 瓊脂糖凝膠電泳染色法:
取擴(kuò)增產(chǎn)物10μl點(diǎn)樣于2%瓊脂糖凝膠中, 70V電泳15-20min,溴化乙錠染色5min,于紫外燈下觀察結(jié)果,在溴酚蘭后面有一條,或二條亮紅條帶為陽(yáng)性結(jié)果,HSV-2帶在前,HSV-1帶在后,無(wú)帶則為陰性結(jié)果。
② Southern印跡法:
PCR產(chǎn)物20μl 經(jīng)電泳分離后,用變性液處理60min,再用中和液處理90min,轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,80℃烤膜2h,42℃預(yù)雜交(雜交液中)30min,加入32P標(biāo)記HSV探針后,42℃雜交過(guò)夜,次日用1%SDS/PBs pH7。2,42℃洗15min,0.5%SDS/PBS pH7.2,42℃洗15min;膜置X線(xiàn)暗盒內(nèi),放射性自顯影12-15h,,顯影為陽(yáng)性,不顯影為陰性。
(三)、聚合酶鏈反應(yīng)—酶譜法(polymerase chain reaction-endonucleasecleavage PCR-EC)
具有經(jīng)濟(jì)廣泛等特點(diǎn);不僅能一次性分型檢測(cè)HSV-1,HSV-2,EBV,CMV四種病毒,而且方法本身快速、方便、無(wú)放射線(xiàn)損傷,易被實(shí)驗(yàn)室接受??蓹z出3個(gè)CFU的HSV1,靈敏度高,能檢測(cè)出中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染第1dCSF中HSv DNA陽(yáng)性結(jié)果,并可用于藥物治療效果的評(píng)價(jià)。由于病毒的變異性,會(huì)出現(xiàn)酶切點(diǎn)突變丟失現(xiàn)象,從而造成酶切陰性結(jié)果。對(duì)此可以通過(guò)型特異性探針或序列分析解決。
1. 標(biāo)本處理
(1) 標(biāo)本采集,方法同上。
(2) DNA模板制備:每份標(biāo)本取200μl,按200μg/ml加入蛋白酶k,56℃作用1h;
加入等體積的酚—氯仿(v/v)輕搖10min,離心1000r/min×5min;取水相加入500μl(2.5倍體積)無(wú)水乙醇,-20℃過(guò)夜沉淀DNA,離心15000r/min×5min,吸去液體,30℃干燥后,加蒸餾水25μl溶解,待檢。
2. 引物設(shè)計(jì):
P1,5′CGACTTTGCCAGCCTGTACC3′
P2,5′AGTCCGTGTCCCCGTAGATG3′
(1)PCR實(shí)驗(yàn)體系:
反應(yīng)體積100μl; 模板10μl ; P1 0.5μl(10pmol/L) ,P20.5μl(10pmol/L); 4×dNTP 4μl(4×200mmol/L); 10×緩沖液10μl, DMSD 5μl, Dw 65μl, 循環(huán)參數(shù)為94℃60s;60℃60s; 72℃60s;循環(huán)40次72℃延伸4min。
(2)擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)與酶切分型.
①第一步電泳鑒定: 取10μlPCR產(chǎn)物加4μl樣品緩沖液,加入2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳(5-20min)加EB染色5min后,紫外燈下觀察,可初步鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物大小。
②酶切分析:分別取20μlPCR產(chǎn)物于2個(gè)Eppendorf管中,加入50μl無(wú)水乙醇,-20℃沉淀DNA,再分別用20μlSmal和BamHI反應(yīng)緩沖液溶解,加入SmaI或BamHi50U于相應(yīng)Eppendorf 管內(nèi),37℃作用1h。
③第二步電泳分型,取10μlPCR酶切物加4μl樣品緩沖液,加到2%瓊脂糖凝膠中,70V電泳,15-20min后,EB染色5min,與同步加入未酶切的PCR產(chǎn)物相對(duì)照。 紫外燈下觀察,結(jié)果如下:
PCR-EC法檢測(cè)四種病毒結(jié)果
(四)用RT-PCR檢測(cè)單純皰疹病毒
RNA的聚合酶鏈反應(yīng)(RNA-PCR),可能通過(guò)檢測(cè)HSV不同期的RNA,這不僅可診斷HSV感染,而且有利于HSV的潛伏期感染機(jī)制的深入研究。
RT-PCR是以RNA為模板經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(RT)產(chǎn)生cDNA,再以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增以達(dá)到檢測(cè)目的。因此,RNA-PCR也可稱(chēng)為RT-PCR。
1、標(biāo)本處理:
組織塊細(xì)胞總RNA提取,取100mg組織標(biāo)本,加1ml硫氰酸胍變性液,于勻漿器中,室溫研磨均勻后,移入2.5mlEppendorf 管中。依次加入0.1ml3mol/L(pH4.0)NaAc,1ml水飽和酚和0.2ml氯仿一異戊醇混勻,用力振搖10s, 置冰浴15min。10000g4℃,離心20min,取上清水相(上層DNA、下層DNA和變性蛋白質(zhì))加入等體積異丙醇置-20℃1h,沉淀RNA。離心 15000r/min×10min,棄上清, RNA重新用0.3ml硫氰酸胍變性液溶解,再加0.3ml異丙醇沉淀,-20℃1h, 沉淀RNA. 離心15000r/min×10min,去上清, 沉淀RNA用75%冷乙醇洗一次, 真空干燥。.加10μl TE緩沖液(pH7.4)溶解,低溫保存?zhèn)溆?臨用前冰浴溶解。
2、PCR擴(kuò)增:
(1) 引物設(shè)計(jì): 選擇HSV-1ICPO基因(極早期)為檢測(cè)靶基因.設(shè)計(jì)2個(gè)引物,
P1 5′GGATCCTCACGTGGTTACCCGCGGTCT 3′
P2 5′AAGCTTCCGGGGCCGTCCCCGCGGGCG 3′可以擴(kuò)增ICPO 中266bp序列。
1個(gè)探針:5′CCGGCTGGAGCCGCCGCACCCTGCT3′。
(2)PCR實(shí)驗(yàn)體系:總反應(yīng)體積為50μl,模板10μl (0.25-1.0μg)P1 1μl (20pmol/L);P2 1μl (20pmol/L);4×dNTP 4μl(200μmol/L); 10×緩沖液5μl; AMV(逆轉(zhuǎn)錄酶)2μl(50U); DW 26μl; 循環(huán)參數(shù), 94℃變性2min后 94℃50s,60℃60,72℃60s,循環(huán)40次后72℃延伸5min。
3、擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定:
(1)瓊脂糖凝膠電泳染色法:取10μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加4μl 樣品緩沖液,混勻后加樣2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳15-20min,EB染色5min。紫外燈下觀察擴(kuò)增條帶。
(2)Southern印跡雜交法:用32P標(biāo)記的特異性探針檢測(cè)PCR產(chǎn)物,方法同上。
總之,在HSV感染性疾病的臨床診斷中,PCR能對(duì)前病毒或潛伏期低復(fù)制的HSV特異性靶DNA片段進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè),遠(yuǎn)較DNA探針敏感,并能在血清中抗體出現(xiàn)前就可以檢出。因此,PCR無(wú)論是作為基礎(chǔ)研究手段,還是作為臨床檢驗(yàn)診斷方法,均具有廣闊的前景。
五、病理組織學(xué)診斷
細(xì)胞內(nèi)水腫,基底層形成大水皰,病灶周?chē)卸嗪司藜?xì)胞浸潤(rùn),特別是多核白細(xì)胞與淋巴細(xì)胞充斥于病灶中間。
(公元 588 年)劉宋,雷斅著。三卷。是論述藥物加工制作的專(zhuān)書(shū)。原書(shū)已佚,其內(nèi)容散見(jiàn)于《證類(lèi)本草》中,近人有輯本。
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HSV感染的診斷要依據(jù)病史、臨床表現(xiàn)和實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果而定。有不潔性交史,而且在生殖器部位出現(xiàn)皮膚紅斑和原發(fā)性水皰,易復(fù)發(fā)等不難診斷。必要時(shí)可作皰液涂片,培養(yǎng)、接種、免疫熒光檢查。血清免疫抗體測(cè)定等,均有助于診斷和確定病毒類(lèi)型。
一、細(xì)胞學(xué)方法
對(duì)皮損刮片做Wright-Gemsa (Tzanck試驗(yàn))或Papanicolaou染色,可檢出HSV感染特征的巨細(xì)胞包函體,但不能區(qū)別HSV感染或水痘— 帶狀皰疹病毒感染,敏感性?xún)H為病毒分離的60%。
二、培養(yǎng)法
從水皰底部取材做組織培養(yǎng)分離病毒,為目前較敏感、最特異的檢查方法,需5-10天,因其技術(shù)條件要求高,價(jià)格昂貴,不能普遍使用。
三、抗體檢測(cè)
目前最廣泛的是HSV-2抗體檢測(cè),如蛋白印跡法也可用gD2作抗原檢測(cè)HSV-2抗體,具有敏感性,且能區(qū)分HSV-1和HSV-2的優(yōu)點(diǎn)。
四、基因診斷
(一)用PCR分型檢測(cè)單純皰疹病毒
PCR是一種敏感性高,特異性強(qiáng)的快速檢測(cè)方法,標(biāo)本中含有1fg HSV-DNA就可以檢出,其在HSV感染的診斷研究中發(fā)展較快,且分型檢測(cè)HSV是發(fā)展的趨勢(shì)。
1、標(biāo)本采集和處理
(1)標(biāo)本采集
①腦脊液:直接無(wú)菌采取患者0.5ml腦脊液標(biāo)本于無(wú)菌試管送檢.如肉眼可見(jiàn)血色,應(yīng)離心取上清。
②羊水及嬰兒血清: 同上,應(yīng)避免溶血.
③腦組織: 腦組織尸檢、活檢標(biāo)本,加1ml PBS標(biāo)本緩沖液研磨后,待檢。
④眼及皮膚病灶分泌物:用預(yù)測(cè)(半干)棉拭子直接取患處分泌物,置1ml PBS標(biāo)本緩沖液中送檢。
⑤生殖器(宮頸、陰道、外陰、陰莖)標(biāo)本:先用消毒棉拭子擦去病變部位表面粘液、污垢,再用預(yù)潮棉拭子用力擦拭患處分泌物,置1ml PBS標(biāo)本緩沖液中送檢。
(2)標(biāo)本處理
①預(yù)處理:所有液體標(biāo)本均可直接進(jìn)行模板制備;可以取100μl標(biāo)本液,離心5000r/ min×5min后,去上清,取沉淀物進(jìn)行模板制備。
②模板制備:a: 蛋白酶K消化裂解法:沉淀物加100μl蛋白酶K消化裂解液,55℃1h后,煮沸10 min,離心5000 r/ min×5min,收集上清。 b:水煮法:沉淀物加100μl蒸餾水,搖均水煮20 min,離心5000 r/ min×5min收集上清。c:1%Triton X-100裂解法:取采集的標(biāo)本液100μl,加入1μl Triton X-100,水煮20 min,5000 r/ min×5min,收集上清。d: 5%NP-40裂解法:取采集的標(biāo)本液100μl,加5μl NP-40,水煮20 min ,5000r/ min×5min收集上清。e:如標(biāo)本溶血嚴(yán)重經(jīng)上述裂解處理后,再加等體積酚-氯仿抽提、冷乙醇沉淀DNA,加10μlDW溶解待檢。
2、PCR擴(kuò)增
(1)引物設(shè)計(jì)。以HSV DNA聚合酶的高保守區(qū)為檢測(cè)靶序列以確保特異性。設(shè)計(jì)3個(gè)引物,一個(gè)上游共同性引物,DNAP5(5′ATGGTGAAAACATCGACATGTACGG3′):二個(gè)下游特異性引物,DNAP3-1(5′CCTCGCGTTCGTCCTCGTCCTCC3′?。┖虳NAP3-2(5′CCTCCTTGTCGAGGCCCCGAAAC3′),可以分別擴(kuò)增出HSV-1469bpDNA片段(1981~2359)、HSV-2 391bp片段(1561~1953):從二型PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中設(shè)計(jì)了一個(gè)不分型的特異性探針HSVP3 5‘GGCGTAGTAGGCGGGGATGTCGCG 3‘)。
(2)PCR實(shí)驗(yàn)體系。取模板10μl: DNAP5 0.5(0.2μmol/L):DNAP3-10.5μl (0.2μmol/L):DNAP3-2 0.5μl (0.2μmol/L):4×dNTP 8μl(4×200μmol/L):10×dNTp 8μl(4×200μmol/L);10×緩沖液10μl:DMSO 4μl;加DW65.5μl;石蠟油 30μl.。
水煮(96℃~100℃)7min加TaqDNA聚合酶1μl;(2.5U)72℃4 min↓
95℃40s
↓ 65℃60s →72℃70s
↓33個(gè)循環(huán)
70℃4 min
3.?dāng)U增產(chǎn)物的檢測(cè)和分析
(1)瓊脂糖凝膠電泳染色法:取擴(kuò)增產(chǎn)物20μl加樣品緩沖液4μl混勻后,點(diǎn)樣于2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳15~20min,溴化乙錠(EB)染色5min,于紫外燈下觀察結(jié)果在溴酚藍(lán)后面有一條或二條亮紅帶為陽(yáng)性結(jié)果,HSV-2帶在前,HSV-1帶在后,無(wú)帶則為陰性結(jié)果。
(2)XhoI酶譜法:取HSV-1型PCR產(chǎn)物50μl加X(jué)hoI50U,37℃1h后,置3%瓊脂糖凝膠中,70V電泳15~20min,可產(chǎn)生46bp片段帶(引物后面);與正常PCR產(chǎn)物比較,XhoI酶切后的大片段電泳位置前移。
(3)Southern印跡法:PCR產(chǎn)物20μl經(jīng)電泳分離后,用變性液處理60min,再用中和液處理90min,轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上:80℃烤膜2 h,42℃預(yù)雜交(雜交液中)30min,加入32p標(biāo)記HSVP3探針后,42℃雜交過(guò)夜;次日用1%SDS/ PBs pH7.2, 42℃洗15min, 0.5%SDS/PBS pH7.2, 42℃洗15min; 膜置X線(xiàn)暗盒內(nèi)放射性自顯影12~15h,顯影為陽(yáng)性, 不顯影為陰性。
(二)套式PCR
套式PCR(nested primers-polymerase chain reaction,NP-PCR)是通過(guò)“外側(cè)”、“內(nèi)側(cè)”兩對(duì)引物,即一對(duì)擴(kuò)增較大DNA片段的“外側(cè)”引物和一對(duì)位于擴(kuò)增產(chǎn)物中再擴(kuò)增小片段的“內(nèi)側(cè)”引物,這樣兩次連續(xù)放大可以提高PCR檢測(cè)的靈敏度,保證產(chǎn)物的特異性。但該方法不能分型,能100%檢出HSV-1,50%檢出HSV-2,應(yīng)改進(jìn)分型檢測(cè)HSV,更好地在臨床應(yīng)用和基礎(chǔ)研究中推廣應(yīng)用。
1、 標(biāo)本處理:
(1)標(biāo)本采集同上
(2)DNA 制備:①腦脊液:取100μlCSF 水煮15min,加入250μl無(wú)水乙醇,放-30℃10min;離心10000g30 min,去上清,30℃干燥后,加入10μl DW; ②腦組織細(xì)胞:取沉淀物加100μl蛋白酶K消化裂解液,56℃作用1h,水煮10min;取上清加入等體積酚一氯仿(V/V),輕搖10 min,離心10000r/min×10min;取水相,加入250μl DW溶解。
2、PCR擴(kuò)增
(1)引物設(shè)計(jì):選擇HSV1糖蛋白D基因?yàn)闄z測(cè)靶基因。
NP-PCR 的引物和探針序列
“外”引物BJHSV1.1ATCACGGTAGCCCGGCCGTGTGACA19-43BJHGV1.2CATACCGGAACGCACCACACAA218-239“內(nèi)引物”BJHSV1.3CCATACCGACCACACCGACGA51-79BJHSV1.4CGTAGTTGGTCGTTCGCGCTGAA166-188探針BJHSV-1PROTACGAGGAGGAGCTGTATAACAAAGTCTGT96-125(2) PCR實(shí)驗(yàn)體系和程序: 反應(yīng)體積為50μl;模板10μl;BJHSV1.10.5μl(0.2pmol/L); BJHSV1.2 0.5μl(0.2pmol/L); 10×緩沖液5μl; 4×dNTp 4μl(4×200mmol/L);DW 27μl; 石蠟油30μl。循環(huán)參數(shù)為95℃30s;55℃30s; 72℃60s; 循環(huán)20次, 取其擴(kuò)增產(chǎn)物1μl加入含有BJHSV1.3和BJHSV1.4反應(yīng)體系中進(jìn)行套式擴(kuò)增,先95℃變性2min,循環(huán)參數(shù)為95℃30s;55℃30s; 72℃60s; 循環(huán)30次后,72℃延伸5min;。
(3) 擴(kuò)增產(chǎn)物分析:
① 瓊脂糖凝膠電泳染色法:
取擴(kuò)增產(chǎn)物10μl點(diǎn)樣于2%瓊脂糖凝膠中, 70V電泳15-20min,溴化乙錠染色5min,于紫外燈下觀察結(jié)果,在溴酚蘭后面有一條,或二條亮紅條帶為陽(yáng)性結(jié)果,HSV-2帶在前,HSV-1帶在后,無(wú)帶則為陰性結(jié)果。
② Southern印跡法:
PCR產(chǎn)物20μl 經(jīng)電泳分離后,用變性液處理60min,再用中和液處理90min,轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,80℃烤膜2h,42℃預(yù)雜交(雜交液中)30min,加入32P標(biāo)記HSV探針后,42℃雜交過(guò)夜,次日用1%SDS/PBs pH7。2,42℃洗15min,0.5%SDS/PBS pH7.2,42℃洗15min;膜置X線(xiàn)暗盒內(nèi),放射性自顯影12-15h,,顯影為陽(yáng)性,不顯影為陰性。
(三)、聚合酶鏈反應(yīng)—酶譜法(polymerase chain reaction-endonucleasecleavage PCR-EC)
具有經(jīng)濟(jì)廣泛等特點(diǎn);不僅能一次性分型檢測(cè)HSV-1,HSV-2,EBV,CMV四種病毒,而且方法本身快速、方便、無(wú)放射線(xiàn)損傷,易被實(shí)驗(yàn)室接受??蓹z出3個(gè)CFU的HSV1,靈敏度高,能檢測(cè)出中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染第1dCSF中HSv DNA陽(yáng)性結(jié)果,并可用于藥物治療效果的評(píng)價(jià)。由于病毒的變異性,會(huì)出現(xiàn)酶切點(diǎn)突變丟失現(xiàn)象,從而造成酶切陰性結(jié)果。對(duì)此可以通過(guò)型特異性探針或序列分析解決。
1. 標(biāo)本處理
(1) 標(biāo)本采集,方法同上。
(2) DNA模板制備:每份標(biāo)本取200μl,按200μg/ml加入蛋白酶k,56℃作用1h;
加入等體積的酚—氯仿(v/v)輕搖10min,離心1000r/min×5min;取水相加入500μl(2.5倍體積)無(wú)水乙醇,-20℃過(guò)夜沉淀DNA,離心15000r/min×5min,吸去液體,30℃干燥后,加蒸餾水25μl溶解,待檢。
2. 引物設(shè)計(jì):
P1,5′CGACTTTGCCAGCCTGTACC3′
P2,5′AGTCCGTGTCCCCGTAGATG3′
(1)PCR實(shí)驗(yàn)體系:
反應(yīng)體積100μl; 模板10μl ; P1 0.5μl(10pmol/L) ,P20.5μl(10pmol/L); 4×dNTP 4μl(4×200mmol/L); 10×緩沖液10μl, DMSD 5μl, Dw 65μl, 循環(huán)參數(shù)為94℃60s;60℃60s; 72℃60s;循環(huán)40次72℃延伸4min。
(2)擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)與酶切分型.
①第一步電泳鑒定: 取10μlPCR產(chǎn)物加4μl樣品緩沖液,加入2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳(5-20min)加EB染色5min后,紫外燈下觀察,可初步鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物大小。
②酶切分析:分別取20μlPCR產(chǎn)物于2個(gè)Eppendorf管中,加入50μl無(wú)水乙醇,-20℃沉淀DNA,再分別用20μlSmal和BamHI反應(yīng)緩沖液溶解,加入SmaI或BamHi50U于相應(yīng)Eppendorf 管內(nèi),37℃作用1h。
③第二步電泳分型,取10μlPCR酶切物加4μl樣品緩沖液,加到2%瓊脂糖凝膠中,70V電泳,15-20min后,EB染色5min,與同步加入未酶切的PCR產(chǎn)物相對(duì)照。 紫外燈下觀察,結(jié)果如下:
PCR-EC法檢測(cè)四種病毒結(jié)果
病毒型號(hào)靶片段SmaIBamHIHSV1518bp476bp+42bpHSV2518bp—225+293bpEBV524bp100bp+424bp277bp+247bpCMV589bp不需酶切,第一步電泳就可以區(qū)分(四)用RT-PCR檢測(cè)單純皰疹病毒
RNA的聚合酶鏈反應(yīng)(RNA-PCR),可能通過(guò)檢測(cè)HSV不同期的RNA,這不僅可診斷HSV感染,而且有利于HSV的潛伏期感染機(jī)制的深入研究。
RT-PCR是以RNA為模板經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(RT)產(chǎn)生cDNA,再以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增以達(dá)到檢測(cè)目的。因此,RNA-PCR也可稱(chēng)為RT-PCR。
1、標(biāo)本處理:
組織塊細(xì)胞總RNA提取,取100mg組織標(biāo)本,加1ml硫氰酸胍變性液,于勻漿器中,室溫研磨均勻后,移入2.5mlEppendorf 管中。依次加入0.1ml3mol/L(pH4.0)NaAc,1ml水飽和酚和0.2ml氯仿一異戊醇混勻,用力振搖10s, 置冰浴15min。10000g4℃,離心20min,取上清水相(上層DNA、下層DNA和變性蛋白質(zhì))加入等體積異丙醇置-20℃1h,沉淀RNA。離心 15000r/min×10min,棄上清, RNA重新用0.3ml硫氰酸胍變性液溶解,再加0.3ml異丙醇沉淀,-20℃1h, 沉淀RNA. 離心15000r/min×10min,去上清, 沉淀RNA用75%冷乙醇洗一次, 真空干燥。.加10μl TE緩沖液(pH7.4)溶解,低溫保存?zhèn)溆?臨用前冰浴溶解。
2、PCR擴(kuò)增:
(1) 引物設(shè)計(jì): 選擇HSV-1ICPO基因(極早期)為檢測(cè)靶基因.設(shè)計(jì)2個(gè)引物,
P1 5′GGATCCTCACGTGGTTACCCGCGGTCT 3′
P2 5′AAGCTTCCGGGGCCGTCCCCGCGGGCG 3′可以擴(kuò)增ICPO 中266bp序列。
1個(gè)探針:5′CCGGCTGGAGCCGCCGCACCCTGCT3′。
(2)PCR實(shí)驗(yàn)體系:總反應(yīng)體積為50μl,模板10μl (0.25-1.0μg)P1 1μl (20pmol/L);P2 1μl (20pmol/L);4×dNTP 4μl(200μmol/L); 10×緩沖液5μl; AMV(逆轉(zhuǎn)錄酶)2μl(50U); DW 26μl; 循環(huán)參數(shù), 94℃變性2min后 94℃50s,60℃60,72℃60s,循環(huán)40次后72℃延伸5min。
3、擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定:
(1)瓊脂糖凝膠電泳染色法:取10μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加4μl 樣品緩沖液,混勻后加樣2%瓊脂糖凝膠板,70V電泳15-20min,EB染色5min。紫外燈下觀察擴(kuò)增條帶。
(2)Southern印跡雜交法:用32P標(biāo)記的特異性探針檢測(cè)PCR產(chǎn)物,方法同上。
總之,在HSV感染性疾病的臨床診斷中,PCR能對(duì)前病毒或潛伏期低復(fù)制的HSV特異性靶DNA片段進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè),遠(yuǎn)較DNA探針敏感,并能在血清中抗體出現(xiàn)前就可以檢出。因此,PCR無(wú)論是作為基礎(chǔ)研究手段,還是作為臨床檢驗(yàn)診斷方法,均具有廣闊的前景。
五、病理組織學(xué)診斷
細(xì)胞內(nèi)水腫,基底層形成大水皰,病灶周?chē)卸嗪司藜?xì)胞浸潤(rùn),特別是多核白細(xì)胞與淋巴細(xì)胞充斥于病灶中間。