對(duì)人和生物有害的微生物、寄生蟲(chóng)等病原體和變應(yīng)原等污染水、氣、土壤和食品,影響生物產(chǎn)量和質(zhì)量,危害人類健康，這種污染稱為生物污染。

 水、氣、土壤和食品中的有害生物主要來(lái)源于生活污水、醫(yī)院污水、屠宰、食品加工廠污水、未經(jīng)無(wú)害化處理的垃圾和人畜糞便，以及大氣中的飄浮物和氣溶膠。其中主要含有危害人與動(dòng)物消化系統(tǒng)和呼吸系統(tǒng)的病原菌、寄生蟲(chóng)，引起創(chuàng)傷和燒傷等繼發(fā)性感染的溶血性鏈球菌、金黃色葡萄球菌等，以及可引起呼吸道、腸道和皮膚病變的花粉、毛蟲(chóng)毒毛、真菌孢子等大氣變應(yīng)原。這些有害生物對(duì)人和生物的危害程度主要取決于微生物和寄生蟲(chóng)的病原性、人和生物的感受性以及環(huán)境條件三個(gè)因素。

空氣中的微生物多數(shù)是借助土壤以及人和生物體傳播,或借助大氣飄浮物和水滴傳播。飄浮物以及病人、病畜等的噴嚏、咳嗽等排泄物和分泌物所攜帶的微生物中，常見(jiàn)的有桿菌(如無(wú)色桿菌、芽孢桿菌)、球菌(如細(xì)球菌、八疊球菌)、霉菌、酵母菌和放線菌等腐生性微生物(見(jiàn)大氣生物污染)。地面的微生物、大氣中飄浮的微生物均可進(jìn)入水中而污染水體。河川、湖泊淡水中微生物的數(shù)量一般取決于季節(jié)、降雨量和流入水量。鄰近城鎮(zhèn)的水體，含有害微生物和寄生蟲(chóng)卵較多。地下水如井水、泉水，埋藏愈深，微生物愈少。受污染的水體可帶有傷寒、痢疾、結(jié)核桿菌和大腸桿菌，還有螺旋體和病毒。水體中的寄生蟲(chóng)有血吸蟲(chóng)(卵和毛蚴)、痢疾變形蟲(chóng)、線蟲(chóng)、賈第蟲(chóng)以及一些有害昆蟲(chóng)如蚊、蚋、舌蠅等的幼蟲(chóng)。海水中病原菌比淡水少，但海濱、港口因接納污水，也常含有病原菌(見(jiàn)水體生物污染)。水生生物中常帶有致病菌。魚(yú)的受污染部位主要是口腔、鰓、胃、腸及排泄腔等。貝類中與病原菌關(guān)系密切的是牡蠣，它可傳播傷寒。土壤中分布最廣的是腸道致病性原蟲(chóng)和蠕蟲(chóng)類，有的寄生在動(dòng)、植物體內(nèi)，有的通過(guò)土壤穿透皮膚進(jìn)入人體，有的病毒也可通過(guò)土壤使人感染。有些微生物如結(jié)核桿菌，可在干燥細(xì)小的土壤顆粒中生存很長(zhǎng)時(shí)間，以后隨風(fēng)進(jìn)入空氣，再被人畜吸入而引起感染。土壤的生物污染不僅可引起人畜疾病，還能使農(nóng)業(yè)生產(chǎn)遭受嚴(yán)重?fù)p失(見(jiàn)土壤生物污染)。

有害微生物和寄生蟲(chóng)或卵污染食品，可使食品腐敗或產(chǎn)生毒素，使人食后中毒，或使人患寄生蟲(chóng)病。飼料受霉菌如黃曲霉的毒素污染，可使魚(yú)和哺乳動(dòng)物誘發(fā)原發(fā)性肝癌。玉米、花生、稻米、小麥、高粱、小米等都會(huì)受到黃曲霉毒素的污染。在食品中繁殖產(chǎn)生毒素的有肉毒桿菌和葡萄球菌，還有使胃腸道發(fā)生急性炎癥的腸炎沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌和豬霍亂沙門氏菌等。含有炭疽桿菌的肉食品，人食用后也會(huì)得病(見(jiàn)食品生物污染)。

各種病原微生物在水中存活的時(shí)間各不相同，并與水質(zhì)、水溫、pH值等因素有關(guān)。如沙門氏菌在水溫較低和水中營(yíng)養(yǎng)物較多時(shí)存活時(shí)間較長(zhǎng);志賀氏菌在清潔水中較在污水中存活時(shí)間長(zhǎng);霍亂弧菌在雜菌多的水中存活時(shí)間較短，水的pH值在5.6以下時(shí),即不能生存;病毒一般在水溫較低的條件下存活時(shí)間較長(zhǎng)。微生物在空氣中的生長(zhǎng)和繁殖，同空氣濕度、溫度和光線等因素有關(guān)。在空氣中生存時(shí)間較長(zhǎng)的是一些有孢子或芽孢的微生物。土壤中病原蟲(chóng)和寄生蟲(chóng)的生存時(shí)間則與土質(zhì)、水分、溫度、pH值，以及有無(wú)某些寄生物的中間宿主等因素有關(guān)。食品則由于種類繁多，性質(zhì)各異，在一定的外界條件下，適于一定的微生物生存。

水體受氮、磷等物質(zhì)污染，引起藻類及其他水生生物大量繁殖而產(chǎn)生的富營(yíng)養(yǎng)化，也是水體生物污染的一種現(xiàn)象。

防止生物污染必須采取綜合防治措施。要嚴(yán)格控制污染源;加強(qiáng)對(duì)病原生物在環(huán)境中傳布途徑的研究，以便采取適當(dāng)?shù)姆椒?物理的、化學(xué)的或生物的)進(jìn)行防治;還要注意工業(yè)的合理布局以及生產(chǎn)過(guò)程的消毒和檢驗(yàn)措施(如植物種子的消毒浸種、拌種、有機(jī)肥料的無(wú)害化處理、食品生產(chǎn)的嚴(yán)格衛(wèi)生檢驗(yàn)等)。